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功能介绍

astPCR软件是一个集成工具环境，提供全面和专业的设施，可用于设计用于标准，长距离，反向，实时PCR(LUX和自我报告)，多重PCR，Xtreme链反应(XCR)重叠延伸PCR(OE-PCR)多片段组装克隆和LAMP(环介导的等温扩增);组合特异性(用于遗传相关DNA序列的通用引物)或独特(每种遗传相关DNA序列的特异性引物);单引物PCR(从紧密定位的反向重复序列设计PCR引物)，自动检测SSR基因座和直接PCR引物设计，氨基酸序列简并PCR，聚合酶链组装(PCA)，设计跨越感兴趣的区域以及更多。

用于全基因组或者染色体列表的“insilico”(虚拟)PCR引物或探针搜索或者计算机模拟PCR，或者可能的PCR产物的预测以及指定引物或探针的潜在错配位置的搜索。在一定范围内同时搜索多个目标。“insilico”寡核苷酸搜索有助于在温度解链和PCR退火温度计算中发现目标结合位点。

长寡核苷酸可以设计用于微阵列分析和双标记寡核苷酸用于探针如分子信标。

全面的引物测试，标准和简并寡核苷酸的解链温度计算，引物的PCR效率和语言复杂性，稀释和重悬计算器。

针对所有引物二级结构分析引物(探针)，包括与Watson-Crick碱基配对(如G/C-四联体或摇摆碱基对(如GG，GT，GA)，发夹，自身二聚体和交联剂)二聚体引物对。该软件针对所有工具使用正常引物和退化引物的组合，并且熔化温度计算基于最近邻热力学参数。

FastPCR具有处理长序列和核酸或蛋白质序列组的能力，并且允许每个给定序列的个体任务和参数以及加入多个不同的任务以进行单次运行。它也允许序列编辑和数据库分析。

通过可视化技术开发并应用于程序的各种类型重复的高效和完整检测。

该程序包括各种生物信息学工具，用于分析具有GC或AT偏斜，CG%和GA%含量以及嘌呤-嘧啶偏斜的序列，语言序列的复杂性;一代随机DNA序列，限制性I-II-III型酶和归巢核酸内切酶分析，寻找或创建编码序列的限制酶识别位点，支持序列聚类和共有序列的产生以及序列的相似性和保守性分析。